FROM ORGANIC SYNTHESIS TO MOLECULAR MODELING: INVESTIGATION OF THE POTENTIAL EFFECTIVENESS OF UREA-CONTAINING LACTAM DERIVATIVES AGAINST BIOLOGICAL TARGETS USING IN SILICO METHODS

Creative Commons License

Koca İ., Kıbrız İ. E., Görgeç İ. S., Sert Y.

11th INTERNATIONAL CONGRESS on GLOBAL PRACTICE OF MULTIDISCIPLINARY SCIENTIFIC STUDIES-XI, Munich, Almanya, 13 - 17 Ekim 2025, ss.2422-2431, (Tam Metin Bildiri)

  • Yayın Türü: Bildiri / Tam Metin Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Munich
  • Basıldığı Ülke: Almanya
  • Sayfa Sayıları: ss.2422-2431
  • Yozgat Bozok Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Hibrit molekül stratejisi, farmasötik kimyada etkinliği yüksek, çoklu biyolojik hedeflere yönelimli

yeni ilaç adaylarının geliştirilmesinde yaygın olarak kullanılan bir sentez stratejisidir. Bu yaklaşım

ile farklı farmakofor grupları tek bir molekül üzerinde birleştirilerek sinerjik biyolojik etkiler elde

edilmektedir. Laktam türevleri antimikrobiyal, antikanser ve enzim inhibitör aktiviteleriyle

tanınırken, üre türevleri özellikle kinaz inhibitörleri ve antitümör ajanlarda geniş uygulama alanına

sahiptir. Bu iki yapının birleşmesiyle elde edilen hibrit moleküllerin, çoklu etki mekanizmaları

sayesinde daha güçlü biyolojik aktivite göstereceği öngörülmektedir.

Bu çalışmada, medisinal açıdan kritik öneme sahip laktam, üre fonksiyonel grubuna sahip bir seri

yeni molekül (2-CN, 2-FN, 2-HN, ve 2-LN) sentezlenmiş, spektroskopik yöntemlerle (¹H-NMR,

¹³C-NMR, FT-IR, HRMS) kimyasal yapıları analiz edilmiştir. Ayrıca, sentezlenen moleküller

SwissTarget ile biyolojik etkin olabileceği hedefler belirlenmiştir. Bu hedeflerden Karbonik

Anhidraz I (CA-I, PDB ID: 1CZM) proteini ile olası inhibitör etkileşimleri araştırılmıştır. Hedef

protein PharmMapper veritabanı aracılığıyla belirlenmiş ve ardından AutoDock Vina kullanılarak

moleküler kenetlenme simülasyonları gerçekleştirilmiştir. Kenetlenme analizleri, test edilen

moleküller arasında bağlanma enerjileri açısından belirgin farklılıklar olduğunu ortaya koymuştur.

Bunlar arasında 2-CN molekülü en güçlü etkileşim profilini göstermiştir; -8.9 kcal/mol bağlanma

enerjisi, 0.299 µM inhibisyon sabiti (Ki) ve altı geleneksel hidrojen bağı oluşturarak diğer

ligandlara kıyasla daha yüksek bir inhibitör potansiyel sergilemiştir. Bu sonuçlar, 2-CN

molekülünün CA-I enziminin güçlü bir inhibitörü olabileceğini ortaya koymakta ve yeni Karbonik

Anhidraz inhibitörlerinin rasyonel tasarımı ve optimizasyonu için umut verici bir aday olduğunu

göstermektedir