Akademik Veri Yönetim Sistemi
Mediterranean Agricultural Sciences, cilt.33, sa.2, ss.259-265, 2020 (Hakemli Dergi)
Bitki-mikrop interaksiyonlarında ekspresyonu değişim gösteren genlerin tanımlanması,
konukçu direnci ve duyarlılığında gerçekleşen fizyolojik değişimler ve bunlardan sorumlu
genetik faktörler ve mekanizmalar hakkında değerli bilgiler sağlamaktadır. Mısır (Zea mays)
ve mısır pası (Puccinia sorghi) uyumlu interaksiyonunda gerçekleştirdiğimiz çalışmada,
ekspresyonu değişim gösteren 98 transkript derivativi fragment (TDF) tanımlanmıştır.
Klonlanarak sekans karakterizasyonu yapılan 72 TDF ile gerçekleştirilen GenBankası
taramaları, münferit etiketler için bir veya daha fazla benzer kayıt bulunduğunu
göstermektedir. Genel olarak, TDF’lerin yaklaşık yarısının fonksiyonu bilinen genlerin
sekanslarına benzer olduğu ve bunların önemli bir bölümünün bitki-patojen
interaksiyonlarında ekspresyonu değişim gösterenler oldukları tespit edilmiştir. Bunlar
arasında, karbonik anhidraz, Bip2, An2, ARP ve ASR3 proteinlerini kodlayan genlere
benzerlik gösteren TDF’ler bulunmaktadır. TDF’lerin kalan bölümü, diğer stres yanıtlarıyla
ilgili olanlar ve karakterize edilmemiş/hipotetik protein kodlayan sekanslara benzerlik
göstermektedir. ZmBip2, ZmCA, ZmcALDH, ZmARP ve ZmARPP3 genleri için RT-qPCR
primerler tasarlanarak kontrol ve infekte materyalde ekspresyon teyitleri yapıldı. ZmCA hariç,
diğerlerinin tespitlerinde gözlenen ekspresyon değişimleri doğrulandı. Sınırlı sayıda TDF
çalışılmış olmakla birlikte, belirli fonksiyonlarla ilişkili olanlarla birlikte fonksiyonu
bilinmeyenler, çalışılan patosistem uyumlu interaksiyonunda ekspresyonu modülasyon
gösteren genler olarak tanımlanmıştır.